选项A正确，收到投资者超出其所占注册资本份额的投资应计入资本公积（资本溢价或股本溢价）；选项B正确，委托证券公司代理发行股票而支付的手续费、佣金应冲减资本公积（资本溢价或股本溢价）；选项C不正确，经股东大会决议用资本公积转增股本的，应从资本公积（资本溢价或股本溢价）转入股本；选项D不正确，新加入投资者出资价格高于原有投资者的出资价格，是补偿原投资者的风险价值、时间价值等，不说明新加入投资者出资价格不公允，超出部分应计入资本公积（资本溢价或股本溢价）。