（1）A公司以C公司为其债务提供了连带保证且有能力代为清偿为由，对破产申请提出的异议不成立。理由：根据企业破产法律制度的规定，对债务人丧失清偿能力、发生破产原因的认定，不以其他对其债务负有清偿义务者（如连带责任人、担保人）也丧失清偿能力、不能代为清偿为条件。
（2）人民法院以A公司现金不足，实物资产大多不能变现清偿债务为由，裁定受理破产申请符合规定。理由：债务人不能清偿到期债务并且具有下列情形之一的，人民法院应当认定其具备破产原因：①资产不足以清偿全部债务；②明显缺乏清偿能力。债务人账面资产虽大于负债，但存在下列情形之一的，人民法院应当认定其明显缺乏清偿能力：第一，因资金严重不足或者财产不能变现等原因，无法清偿债务；第二，法定代表人下落不明且无其他人员负责管理财产，无法清偿债务；第三，经人民法院强制执行，无法清偿债务；第四，长期亏损且经营扭亏困难，无法清偿债务；第五，导致债务人丧失清偿能力的其他情形。题中，A公司已经不能清偿其对B公司的到期债务，且明显缺乏清偿能力，人民法院应当受理B公司对A公司提出的破产清算申请。
（3）对于D公司诉A公司股东甲的债务纠纷案，人民法院应当中止审理。理由：《破产法司法解释（二）》第二十一条规定：“破产申请受理前，债权人就债务人财产提起下列诉讼，破产申请受理时案件尚未审结的，人民法院应当中止审理：①主张次债务人代替债务人直接向其偿还债务的；②主张债务人的出资人、发起人和负有监督股东履行出资义务的董事、高级管理人员，或者协助抽逃出资的其他股东、董事、高级管理人员、实际控制人等直接向其承担出资不实或者抽逃出资责任的；③以债务人的股东与债务人法人人格严重混同为由，主张债务人的股东直接向其偿还债务人对其所负债务的；④其他就债务人财产提起的个别清偿诉讼。破产申请受理前，债权人提起诉讼主张债务人的出资人等直接向其承担出资不实责任，案件在破产申请受理时尚未审结的，人民法院应当中止审理。”
（4）有关债权人关于A公司向E信用社清偿行为无效的主张不成立。理由：根据规定，人民法院受理破产申请后，债务人对个别债权人的债务清偿无效。但是，债务人以其财产向债权人提供物权担保的，其在担保物市场价值内向债权人所作的债务清偿，不受上述规定限制。题中，A公司以其所属厂房为该笔借款向E信用社提供了抵押担保，符合上述规定。
（5）F公司有权提走其委托A公司加工的产品。理由：F公司提供原材料、委托A公司加工产品的合同属于承揽合同，根据企业法律制度的规定，债务人基于承揽合同关系占有的他人财产不应认定为债务人财产，因此F公司可以行使取回权。