根管充填的目的是封闭根管系统，以防止细菌进入根管系统造成根管的再感染和组织液进入根管成为残余细菌的培养基。充填根管不仅有堵塞作用，还借助根充材料有缓慢而持续的消毒作用，消除根管内残余感染，并促进根尖周病变愈合，故A、B、C、D均正确，去除牙髓组织是根管预备阶段，所以选E。