合作经济与集体经济的区别在于：①集体经济是对经济组织的所有制性质而言的，而合作经济是就其组成及运行方式而言的。②专业合作社一般承认社员入社资产的私有权和入股分红权，集体经济组织不承认社员入社资产的所有权和收益分配权。③专业合作社只实行部分的合作化，实际上形成农户分散经营与合作社共同经营相结合的双层经营体制，集体经济组织则实行集中统一经营，集体劳动，统一分配。④在专业合作杜中，社员凭其与合作社的交易额获得利润返还，并按股分红和获得股息。集体经济组织实行按劳分配，其特点是高度平均化。⑤专业合作社是生产要素组合方式，并非特定的所有制形态；集体经济组织则是一种非私有产权形态。