选项A错误，水利工程建设程序一般分为：项目建议书、可行性研究报告、施工准备、初步设计、建设实施、生产准备、竣工验收、后评价等阶段。选项B错误，蓄水安全鉴定工作依据应包括有关法律、法规、规章和技术标准，批准的初步设计报告、专题报告、设计变更及修改文件，以及合同规定的质量和安全标准等。选项E错误，供水、灌溉类项目。水费收入能够完全覆盖投资成本的项目，应采用“使用者付费”模式；水费收入不足以完全覆盖投资成本的项目，可采用“使用者付费+可行性缺口补贴”模式；也可根据项目实际情况，在一定期限内采用“使用者付费+可行性缺口补贴”模式，逐步过渡到“使用者付费”模式，确保工程良性运行。