本题考查耕地占用税税率及计税依据的相关规定。选项B当选，占用园地、林地、草地、农田水利用地、养殖水面、渔业水域滩涂以及其他农用地建设建筑物、构筑物或者从事非农业建设的，适用税额可以适当降低，但降低的部分不得超过50%。选项D当选，未经批准占用的土地面积也应该计入耕地占用税的计税依据。选项E当选，补缴税款时适用税额应按改变用途时的适用税额计算。选项A不当选，人均耕地低于0.5亩的地区，省、自治区、直辖市政府可以适当提高适用税额，但提高的部分不得超过当地规定税额标准的50%。选项C不当选，适用税额是指省、自治区、直辖市人民代表大会常务委员会决定的应税土地所在地县级行政区的现行适用税额。