选项B，由于甲公司取得这部分股权投资后能够对乙公司实施控制，形成了企业合并，因此适用企业合并准则、长期股权投资准则和合并财务报表准则等，不适用非货币性资产交换准则。选项C，补价所占比例=1000/（4000+1000）×100%=20%<25%，适用非货币性资产交换准则。