永久工程、已运至施工现场的材料和工程设备的损坏，以及因工程损坏造成的第三者人员伤亡和财产损失由发包人承担，B说法正确。发包人和承包人承担各自人员伤亡和财产的损失，A说法正确，E说法错误。承包人施工设备的损坏由承包人承担，D说法错误。承包人在停工期间按照发包人要求照管、清理和修复工程的费用由发包人承担，C说法正确。