选项A正确，已完工程预算费用=已完成工程量×预算单价=9000×400=360（万元）；选项B错误，费用偏差=已完工程预算费用-已完工程实际费用=360—450=—90（万元），表示项目运行超出预算费用；选项D正确，已完工程实际费用=已完成工程量×实际单价=9000×500=450（万元）；选项C错误，进度偏差=已完工程预算费用-拟完工程预算费用=360万元-320万元=40（万元），进度超前；选项E正确，拟完工程预算费用=计划工程量×预算单价=8000×400=320（万元）。