(1)被孢子虫侵染的蜜蜂无明显的外观疾病症状，解剖后可发现，孢子虫多从蜜蜂中肠的后端侵入，逐渐向前端发展，被孢子虫侵染的中肠颜色由蜜黄色变为灰白色，并且中肠外表环纹消失，失去弹性，极易破裂。根据该蜂剖检结果，可诊断为孢子虫病。(2)引起孢子虫病的病原为蜜蜂微孢子虫，孢子呈椭圆形，米粒状，在显微镜下带蓝色折光，内藏卷成螺旋形的极丝。(3)孢子虫感染严重时，可使用烟曲霉素防治蜜蜂微孢子虫病，将药物拌入糖浆的效果优于拌入花粉、糖粉、糖饼中饲喂。