超声三维系统软件、脉象仪软件、睡眠监护系统软件都属于第二类医疗器械。故本题的正确答案为D。医疗器械指的是直接或间接用于人体的仪器、设备、器具、体外诊断试剂和校准物、材料以及其他类似或相关的物品（含所需的计算机软件）；其分类按照风险程度由低到高分为三类；用于血源筛查和采用放射性核素标记的体外诊断试剂按照药品管理。