根据异型性大小和累及范围，非典型增生分为轻、中、重三级。轻度非典型增生，异型性较小，累及上皮层的下1/3；中度非典型增生，异型性中等，累及上皮层的下2/3；重度非典型增生，异型性较大，累及上皮2/3以上但未达到全层。轻、中度非典型增生可恢复正常；重度非典型增生较难逆转。目前较多使用上皮内瘤变这一概念来描述上皮从非典型增生到原位癌这一连续的过程，将轻度和中度非典型增生分别称为上皮内瘤变Ⅰ级和Ⅱ级，重度非典型增生和原位癌称为上皮内瘤变Ⅲ级。