质粒是一种细菌细胞内独立于染色体外的环状DNA，它具有自我复制能力，在细胞分裂时可伴随染色体分配到子细胞中去。在克隆中常用的质粒是以加工组合的质粒，由以下几部分构成：1.ori区：质粒复制的起止点。2.par区：保证在细胞分裂过程中智力而被均等的分配至子细胞。3.多克降区：人为构造，该区含多个单一限制性内切核酸酶酶切点，便于在此区将质粒切开而加入外源DN4·选择因子：常含耐抗生素基因或β-半乳糖苷酶基因（lacZ）。