(1）甲公司破产案件应由A市C县基层人民法院管辖。根据规定，破产案件由债务人住所地人民法院管辖。债务人住所地指债务人的主要办事机构所在地。
(2)王某拒绝缴纳剩余40万元出资的理由不成立。根据规定，人民法院受理破产申请后，债务人的出资人尚未完全履行出资义务的，管理人应当要求该出资人缴纳所认缴的出资，而不受出资期限的限制。
(3）王某以甲公司欠其40万元借款本息抵销其欠缴出资的主张不成立。根据规定，债务人股东因欠缴债务人的出资对债务人所负的债务与债务人对其负有的债务抵销，债务人管理人提出异议的，人民法院应予支持。
(4)乙公司无权要求丙公司返还红木。虽然甲公司处分该红木的行为构成无权处分，但丙公司在受让该红木时对甲公司无权处分不知情，已经支付了合理价款，并完成了交付，故丙公司基于善意取得制度取得该红木的所有权，乙公司丧失其对该红木的所有权，故乙公司无权要求丙公司返还红木。
(5）对于甲公司出售红木所得80万元货款，乙公司不享有取回权。根据规定，债务人占有的他人财产被违法转让给第三人，依据物权法的规定第三人已善意取得财产所有权，原权利人无法取回该财产的，转让行为发生在破产申请受理前的，原权利人因财产损失形成的债权，作为普通破产债权请偿。本题中，该红木转让行为发生于2019年4月，而人民法院于2019年6月方裁定受理甲公司的破产申请。