习惯性流产指自然流产连续发生3次或3次以上者，故选项A错误；早期流产最常见的原因是黄体功能不足，故选项B错误；晚期流产最常见的原因是宫颈内口松弛，故选项C错误；每次流产多发生于同一妊娠月份，故选项E错误；甲状腺功能低下也可能导致习惯性流产，故选项D正确。