脑干连有10对脑神经，包括中脑2对（动眼神经、滑车神经）、脑桥4对（三叉神经、展神经、面神经、前庭蜗神经）、延髓4对（舌咽神经、迷走神经、副神经、舌下神经）。脑干内神经核团分两类，一类与脑神经有关，称为脑神经核，共18对，其中运动核12对，感觉核6对，功能较为明确，另一类为非脑神经核，相互形成网络，共同完成相应功能。脑神经核中，孤束核既是一般内脏感觉核，接受心血管、呼吸和消化等系统的一般内脏感觉纤维，又是特殊内脏感觉核，接受面神经舌咽神经传入的味觉纤维。