慢性萎缩性胃炎主要发生于胃窦部，与幽门螺杆菌感染有关。大体可见胃黏膜明显变薄，呈灰白色或灰黄色。黏膜皱襞减少甚至消失，黏膜光滑，黏膜下血管分支清晰可见。镜下除淋巴细胞和浆细胞浸润黏膜全层、淋巴滤泡形成外，主要是胃黏膜固有腺体萎缩，并出现肠上皮和假幽门腺化生，肠上皮化生与胃癌有关。