根分叉区病变指牙周炎的病变波及多根牙的根分叉区，本病只是牙周炎发展的一个阶段，菌斑仍是主要原因。创伤是本病的一个加重因素。约40%的多根牙在牙颈部有釉突，约13%的牙齿釉突较长，伸进分叉区。因该处无牙周膜附着，仅有结合上皮，在牙龈有炎症时，该处易形成牙周袋。是本病的一个解剖因素。