C

笼养蛋鸡疲劳综合症是由于矿物质代谢障碍引起的营养代谢性疾病，主要发病原因有饲料中钙缺乏、过早使用蛋鸡料、钙磷比例不当、维生素D缺乏、缺乏运动、光照不足等。因此笼养蛋鸡疲劳综合征的病因不包括维生素E缺乏。因此答案选C。