鹅肠球虫病的症状与肾球虫病相似，但消化道症状明显。病鹅喜卧，不愿活动，常落群。渴欲增加，饮水后频频甩头。病初排灰白色或棕红色、带血的黏液性粪便，继而排出红色或暗红色、带有黏液的稀粪，甚至为褐色的凝血。幼鹅常在发病后1～2d死亡。耐过的病鹅生长和增重迟缓。病死鹅剖检可见发生急性卡他性出血性肠炎，小肠肿胀，以小肠中段与下段最严重，其中充满稀薄的红褐色液体及脱落的肠黏膜碎片。小肠黏膜出血、坏死，形成伪膜和肠芯。