真菌败血症的常见病原菌是白色念珠菌和热带念珠菌，病程进展缓慢，表现与革兰阴性细菌所致者相似。毒血症症状可被细菌感染和原发病所掩盖，不易早期明确诊断，病损可累及心、肺、肝、脾、脑等脏器及组织，形成多发性小脓肿。本病在应用了足量的适宜的抗生素后仍不见好转时，须考虑到有真菌感染的可能。