(1)家蚕微粒子病：大蚕期发病，体壁缩皱、呈锈色，有微细不规则的黑褐色病斑（或称胡椒蚕），病斑多出现在尾角末端、气]周围和胸腹足的外侧部位；体质虚弱，蜕皮困难，甚至蜕皮中死亡成为半蜕皮蚕。熟蚕期发病：重病蚕不能结茧，轻度发病的蚕多结不正形茧或薄皮黄。家蚕微粒子病病蚕的丝腺，在出现肉眼可见的乳白色脓包状斑块的典型病变时，可通过肉眼诊断法作出确诊。(2)前、中和后部丝腺都可以被微粒子虫寄生；寄生后在丝腺出现肉眼可见的乳白色脓包状的斑块，这是该病害的典型病变。因此从患有家蚕微粒子病的个体（卵、幼虫、蛹和蛾）中，用光学显微镜可检测到微粒子虫的孢子，这是确诊该病害的有效方法。临时标本在光学显微镜的400~640下，可观察到卵圆形并具有很强折光或呈淡绿色的孢子。