房间隔缺损的症状随缺损大小而有区别，轻者可无全身症状，仅在体格检查时发现胸骨左缘第2、3肋间有收缩期杂音。大型缺损者因体循环血量减少而影响生长发育，患儿体格瘦小乏力、多汗和活动后气促。当剧哭、肺炎或心力衰竭时可出现暂时性发绀（暂时性的肺动脉高压，出现暂时性的右向左分流所致)。由于肺循环血流增多而易反复呼吸道感染，严重者早期发生心力衰竭。