影响疫苗免疫效果的因素主要包括：遗传因素、营养状况、环境因素、疫苗质量、病原的血清型与变异、疾病对免疫的影响、母源抗体、病原微生物之间的干扰作用。其中母源抗体的被动免疫对新生动物很重要，对疫苗的接种也有一定的影响，尤其是弱毒疫苗在免疫动物时，如果动物存在较高水平的母源抗体，会严重影响疫苗的免疫效果。因此答案选E。