引起角膜穿孔最常见的原因是异物或外力直接损伤眼角膜，此外化学物质的灼伤、眼睑结构异常、睫毛异常或眼睛周围被毛过长、角膜或眼睛本身的疾病（干眼病）等均可引起。对角膜愈合差或不愈合的顽固性病例以及深层角膜溃疡或角膜穿孔的病例，则必须在进行角膜清创后，采用附近的球结膜来修复或重建眼角膜。因此，犬角膜穿孔修复的方法是采用结膜瓣遮盖术。