母牛卧地不起综合征的主要发病原因包括有矿物质代谢紊乱（低磷酸盐血症、低钾血症或低镁血症），产科性原因（分娩时损伤了产道及周围神经），外伤性原因（骨骼、神经、肌肉、韧带、关节周围组织损伤、骨折及关节脱臼）以及某些剧烈疾病，如肾功能衰竭等。因此，母牛倒地不起综合征的病因不包括蛋白质缺乏。